pdfFactory Pro Entreprise est une version réseau de pdfFactory Pro permettant de crypter les documents à envoyer et de n'autoriser que certaines actions sur ces documents. Les liens insérés sur les documents deviendrons actifs, de même que les adresses e-mail. Ce logiciel est conçu pour un usage en environnement multi-utilisateurs. Une fois le programme installé sur un serveur, chaque client fait appel à cette ressource comme sur un serveur d'impression.